ПОЧВЕННЫЕ БАКТЕРИИ, которые взаимодействуют с растениями, обитают в так называемой ризосфере — миллиметровом слое почвы, примыкающем к корневым волоскам. Именно через эти корневые волоски растения усваивают из почвы питательные вещества и выделяют органические соединения, которыми питаются ризосферные бактерии. Ризосферные бактерии-псевдомонады в свою очередь помогают растениям лучше питаться — синтезируют вещества, которые делают растворимыми и потому доступными для растений труднорастворимые почвенные соединения фосфора и некоторых других необходимых элементов.

Грибы как эукариотные организмы не способны фиксировать молекулярный азот из атмосферы, однако в ассоциациях с грибами азотфиксирующая способность бактерий возрастает по сравнению с чистыми культурами диазотрофных бактерий. Одной из причин усиления азотфиксирующей активности бактерий в ассоциациях с грибами является целлюлолитическая активность грибов, вследствие которой происходит снабжение бактерий доступным энергетическим материалом. Кроме того, благодаря интенсивному потреблению кислорода грибами в процессе разложения целлюлозы, снижается окислительно-восстановительный потенциал среды, что также способствует процессу азотфиксации. В свою очередь, бактерии снабжают грибы необходимым для них азотом (Воронина, 2007).